✔️ Equipements disponibles au sein du Réseau national des Centres de Recherche en Nutrition Humaine (CRNH):

 

▶️ L'UEN gère des installations cliniques dédiés plus particulièrement aux études sur la nutrition humaine préventive chez l'homme sain et le sujet âgé. Ces installations comprennent 5 lits dont 2 sont destinés aux explorations les plus invasives ou nécessitant une surveillance spécifique.

▶️ L'UEN utilise des techniques et équipements associés pour:

  • Composition corporelle par absorptiométrie biphotonique (*DEXA) et impédancemétrie
  • Mesure de la dépense énergétique de repos par calorimétrie indirecte
  • Mesure de la capacité à l'effort (cardiorespiratoire)
  • Dépistage du syndrome d'apnée du sommeil par polygraphie ventilatoire nocturne
  • Identification des syndromes génétiques associés à l'obésité en lien avec le Centre de Référence Maladies Rares (CRMR PRADORT)
  • Cellularité du tissu adipeux
  • Recueil des comportements (consommations et comportement alimentaire, activité physique,  etc..)

* DEXA: examen d'imagerie médicale non invasif et de très faible irradiation par absorptiométrie biphotonique pour une analyse précise des trois composants du corps entier : masse grasse, masse maigre et contenu minéral osseux

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▶️ Localisation multisites des équipements:

➰Site de l'Hôpital Avicenne et Sites de l'UMR1153 CRESS:

➰ Site du Centre Universitaire des Saints-Pères (Paris) :

➰ Site AgroParis Tech/INRAE (Claude Bernard, Massy, Jouy) : 

➰ Description du dispositif analytique:

  • Investigation clinique et phénotypage de précision (comportement alimentaire, activité physique, métabolisme, fonction intestinale et microbiote)
  • Explorations digestives : utilisation des sondes intestinales, technique spécifique au CRNH Ile de France
  • Isotopes stables : marquage intrinsèque des protéines alimentaires au 15N, EH ou 13C ; plateau de spectrométrie de masse isotopique (1 GC-MS, 1 EA-IRMS, 2GC-c-IRMS)
  • Larges cohortes nationales et internationales (SUVIMAX, NUTRINET, METACARDIS.. etc..
  • Modèles animaux : Animalerie rongeurs, phénotypage comportemental et métabolique en réponse à des interventions nutritionnelles.
  • Etudes économétriques, de psycho-sociologie et de neurosciences des choix alimentaires
  • Exploration du métagénome (MétaGenoPolis) et transfert fécal
  • Isolement de nouveaux micro-organismes d’origine humaine et développer des outils d’étude de probiotiques
  • Bio-banques DNA, tissus
  • Développement d’organoïdes

 

▶️ Autres équipements accessibles via le Centre de Recherche et de Médecine de l'Obésité:

➰ Installations dédiées aux analyses cliniques pratiquées en ambulatoire pour l'exploration nutritionnelle de l'obésité:

  • Mesure de la dépense énergétique de repos par calorimétrie indirecte
  • Composition corporelle par absorptiométrie biphotonique et impédance ou par plethysmographie *
  • Dépistage du syndrome d'apnée du sommeil par Cidelec
  • Identification des syndromes génétiques en lien avec le centre de maladie rare
  • Cellularité du tissu adipeux
  • Recueil des comportements (alimentaire, activité physique, stress, etc..)

* Plethysmographie: mesure de l'ensemble des volumes pulmonaires incluant le volume d'air restant dans les poumons après une expiration maximale (volume résiduel)

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➰ Plateforme associée:

Plateforme M.shark  appartenant également à l'Unité de Service UMS BioCore  (Inserm US16 et UAR CNRS 3556), et rattachée à la plate-forme CORSAIRE de Biogenouest

➰ Pour mener à bien ses 5 objectifs de recherche (Nutrition périnatale et santé de l'adulte / Microbiote-Intestin-Cerveau en Santé / Alimentation lipidique et pathologies chroniques / Compréhension de la survenue des allergies / Nutrition-alimentation & Droit), le CRNH Ouest s'appuie sur les équipements de sa Plate-forme de spectrométrie de masse M.shark dotée des équipements suivants:

  • 2 x GC-EI/CI-MS (Q)
  • GC-C-EI-IRMS
  • 2x UPLC-ESI-MS/MS (QqQ)
  • UPC²-ESI-MS/MS (QqQ)
  • UPLC-ESI-HRMS (Q-TOF)
  • nanoLC-ESI-HRMS (Orbitrap)
  • Ultracentrifugeuse

➰ Ces équipements de pointe permettent de réaliser les techniques suivantes dans différentes matrices (Sérum, plasma Tissus Urines Lait maternel Selles Cellules):

  • Analyses non ciblées (lipidomique, métabolomique et protéomique)
  • Analyses quantitatives ciblées (lipides et apolipoprotéines, acides aminés et protéines, acides organiques, sphingolipides permettant d’approcher la résistance à l’insuline, méthylamines et acides gras à chaine courte permettant d’approcher le microbiote intestinal , xénobiotiques...)
  • Analyses cinétiques dans des protocoles impliquant l'utilisation de traceurs enrichis en isotopes stables (fluxomique protéines et métabolites)
  • Analyses structurales et élémentaires (mesure de masses exactes)

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Plateformes associées: Centre d'exploration clinique / Centre d’analyse et spectrométrie de masse:

▶️ Installations accessibles via le Centre d'exploration clinique:

Infrastructure composée des pièces dédiées à l’exploration clinique, chacune équipée de matériels spécifiques à la recherche en nutrition, et animée par du personnel médical et paramédical formé à la nutrition et à la recherche clinique, et des attachés de recherche clinique :

  • 3 Chambres test de jour 
  • 2 Chambres hébergement avec salle de bain: Les chambres sont équipées pour mesure de calorimétrie indirecte et d'impédancemétrie
  • 3 box d'examen
  • 1 Pièce test avec 4 fauteuils de prélèvements
  • 1 Salle de prélèvements avec 1 fauteuil
  • 2 Laboratoires de conditionnement 
  • 1 Box de test Bodpod (appareil de mesure de composition corporelle)
  • 1 Restaurant expérimental avec caméras et cuisine
  • 1 Salle de gym et 2 douches

▶️ Equipements accessibles via le Centre d’analyse par spectrométrie de masse:

➰  2 spectromètres de masse organiques couplés à la chromatographie en phase gazeuse (GC-MS, Agilent Technologies) avec 3 modes d’ionisation disponibles :

  • ionisation par impact électronique
  • Ionisation chimique positive
  • ionisation chimique négative

Les 2 GC-MS sont équipés d’un système d’injection multimodes comprenant la micro-extraction sur phase solide (SPME, Gerstel & CTC Analytics), un GC-MS dispose également d’une interface de thermo-désorption (Markes).

➰  2 spectromètres de masse isotopiques (IRMS, Delta V Advantage, Thermo Scientific et Isoprime, Isoprime Ltd) avec des couplages différents :

  • GC-Combustion
  • GC-pyrolyse
  • Thermal Conversion Elemental Analysis
  • Gasbench  Equilibration & Breath tests

 

 

✔️ Equipements disponibles au sein de MétaGénoPolis:

 

▶️ Equipements de laboratoire pour la collecte, le stockage et la gestion de microbiomes

▶️ Outils de métagénomique quantitative pour le séquençage du génome entier:

  • Pipeline intégré de séquençage à haut débit et de profils métagénomiques à haute résolution
  • Outils de bioinformatique pour la détermination des gènes de base et des gènes accessoires des espèces microbiennes

▶️ Outils de métagénomique fonctionnelle pour le criblage à haut débit:

  • Construction de librairies métagénomiques et réplication de librairies
  • Culture automatisée de clones bactériens, suivie d’une lyse et d’une filtration
  • Développement de nouveaux outils de criblage (technologie du gène rapporteur)
  • Criblage à haut débit sur des cellules épithéliales humaines (luminescence (HTS), fluorescence (HCS), absorbance)
  • Analyse par cytométrie de flux et tri des cellules